全县水资源总量为2736567.06万立方米/年,其中自产地表水27250万立方米/年,地下水总储量为7656.56万立方米/年,客水2701660.5万立方米/年。
地表水—县境内大小24条河流,多发源于海拨3000米以上的拉脊山脉高山区,按流水状况有常年流水河、半流河和时季河,主要靠降水补给,次为高山积雪融水。各河道流量小,但落差大,有发展小水电的潜力。
地下水—山区地下水除解决人畜饮水外,多数渗出地表后又汇入河流成为河川基流,无开采价值,可供开采的仅为平川地区地下水。
客水—资源比较丰富,湟水、黄河、大通河三大过境河流年总径流量为2701660万立方米。现利用水量10171万立方米,占年总径流量的0.37%,其中黄河5765万立方米,湟水3022.4万立方米,成为全县农业灌溉主要水源。