可可西里国家级自然保护区分布的哺乳动物有30种，鸟类54种，爬行类1种，鱼类6种。名录如下：

　　哺乳纲(MAMMALIA)

　　食肉目(CARNIVORA)

　　猫科(Felidae)

　　1、雪豹(Panthera uncia)

　　2、猞猁(Lynx lynx)

　　3、兔狲(Felis manul)犬科(Canidae)

　　4、狼(Canisl upus)

　　5、豺(Cuon alpinus)

　　6、赤狐(Vulpes vulpes)

　　7、藏狐(Vulpes ferrillata)

　　8、沙狐(Vulpes corsac)熊科(Ursidae)

　　9、棕熊(Ursus arctos)鼬科(Mustelidae)

　　10、石貂(Martes foina)

　　11、香鼬(Mustela altaica)

　　12、艾虎(Mustcla eversmanni)

　　13、狗獾(Meles meles)

　　奇蹄目(PERISSODACTYLA)马科(Equidae)

　　14、藏野驴(Equus kiang)

　　偶蹄目(ARTIODACTYLA)

　　牛科(Bovidae)

　　15、野牦牛(Poephagus mutus)

　　16、藏原羚(Procapra picticaudata)

　　17、盘羊(Ovis ammon)

　　18、岩羊(Pseudois nayaur)

　　19、藏羚(Pantholops hodgsoni)

　　鹿科(Cervidae)

　　20、白唇鹿(Cervus albirostris)

　　啮齿目(RODENTIA)

　　松鼠科(Seiuridae)

　　21、喜玛拉雅旱獭(Marmota himalayana)

　　仓鼠科(Cricetidae)

　　22、藏仓鼠(Cricetulus kamensis)

　　23、长尾仓鼠(Cricetulus longicaudatus)

　　田鼠科(Arvieolidae)

　　24、斯氏高山平(Altacola stoliczkanus)

　　25、白尾松田鼠(Pitymys leucurus)

　　跳鼠科(Dipodidae)

　　26、长耳跳鼠(Euchoretes naso)

　　兔形目(LAGOMORPHA)

　　鼠兔科(Ochotonidae)

　　27、黑唇鼠兔(Ochotona curzoniae)

　　28、柯氏鼠兔(Ochotona koslowi)

　　29、拉达克鼠兔(Ochotona ladacensis)兔科(Leporidae)

　　30、高原兔(Lepus oiostolus)

　　鸟纲(AVES)

　　鹳形目(CICONIFORMES)

　　鹭科(Ardeidae)

　　1、大白鹭(Egretta alba)

　　雁形目(ANSERIFORMES)

　　鸭科(Anatidae)

　　2、斑头雁(Anser indicus)

　　3、大天鹅(Cygnus cygnus)

　　4、赤麻鸭(Taborna ferruginea)

　　5、赤嘴潜鸭(Netta rufina)

　　隼形目(FALCONIFORMES)

　　鹰科(Accipitridae)

　　6、大鵟(Buteo hemiasius)

　　7、金雕(Aquila chrysaetos)

　　8、草原雕(Aquila rapax)

　　9、秃鹫(Aegypius monachus)

　　隼科(Faconidae)

　　10、猎隼(Faico cherrug J.E.Gray)

　　11、红隼(Falco tinnunculus)

　　鸡形目(GALLIFORMES)

　　雉科(Phasianidae)

　　12、藏雪鸡(Tetraogallus tibetanus)

　　鹤形目(GRUIFORMES)

　　鹤科(Gruidae)

　　13、黑颈鹤(Grus nigricollis)

　　鸻形目(CHARADRIIFORMES)

　　鸻科(Charadriidae)

　　14、斑鸻(Pluvialis dominca)

　　鹬科(Scolopacidae)

　　15、红脚鹬(Tringa totanus)

　　16、矶鹬(Tringa hypoleucos)

　　鸽形目(COLUMBIFORMES)

　　沙鸡科(Pteroclididae)

　　17、西藏毛腿沙鸡(Syrrhaptes tibetanus)

　　鸠鸽科(Columbidae)

　　18、岩鸽(Columba rupestris)

　　佛法僧目(CORACIIFORMES)

　　戴胜科(Upupidae)

　　19、戴胜(Upupaepops)

　　鸥形目(LARIFORMES)

　　鸥科(Laridae)

　　20、鱼鸥(Larus ichthyaetus)

　　21、棕头鸥(Larus brunnicephalus)

　　22、普通燕鸥(Sterna hirundo)

　　雀形目(PASSERIFORMES)

　　百灵科(Alaudidae)

　　23、长嘴百灵(Melanocorypha maxima)

　　24、短趾沙百灵(Calandrella cinerea)

　　25、细嘴沙百灵(Calandrella acutirostris)

　　26、角百灵(Eremophila alpestris)

　　27、小云雀(Alauda gulgula)

　　燕科(Hirundinidae)

　　28、灰沙燕(Roparia riparia)

　　29、岩燕(Ptyonoprpgne rupestris)

　　30、毛脚燕(Delichon urbica)

　　鹡鸰科(Motacillidae)

　　31、黄头鹡鸰(Motacoilla citreola)

　　32、白鹡鸰(Motacoilla alba)

　　33、平原鹨(Anthus campestris)

　　34、水鹨(Anthus spinoletta)

　　鸦科(Cervidae)

　　35、褐背拟地鸦(Pseudopodoces humilis)

　　36、红嘴山鸦(Pyrrhocorax pyrrhocorax)

　　37、渡鸦(Corvus corax)

　　伯劳科(Laniidae)

　　38、楔尾伯劳(Lanius tephronotus)

　　岩鹨科(Prunellidae)

　　39、棕胸岩鹨(Prunella strophiata)

　　40、褐岩鹨(Prunella fulvescens)

　　鶲科(Muscicapidae)

　　41、蓝点颏(Lusinia calliope)

　　42、赭红尾鸲(Phoenicurus ochruros)

　　43、漠即(Oenanthe isellini)

　　44、黑喉石即(Saxicola torquata)

　　45、棕背鸫(Turdus kessieri)

　　文鸟科(Ploceidae)

　　46、石雀(Petronia peteronia)

　　47、棕背雪雀(Montifrgilla blanfordi)

　　48、黑喉雪雀(Montifrgilla davidiana)

　　雀科(Fringillidae)

　　49、曙红朱雀(Carpodacus eos)

　　50、高山岭雀(Leucosticte nemoricola)

　　51、大朱雀(Carpodacus rubicilla)

　　52、拟大朱雀(Carpodacus rubicilleides)

　　53、红眉朱雀(Carpodacus pulcherrimus)

　　54、灰眉岩鹨(Emberiza cia)

　　爬行纲(REPTILIA)

　　蜥蜴目(LACERTIFORMES)

　　鬣蜥科(Agamimdae)

　　1、青海沙蜥(Phrynocephalus vliangalii)

　　鱼纲(PISCES)

　　鲤形目(CYPRINFORMES)

　　鲤科(Cyprinidae)

　　1、裸腹叶须鱼(Ptychobarbus kaznakovi)

　　2、小头裸裂尻鱼(Schizopygopsis microcephalus)

　　鳅科(Cobitidae)

　　3、长鳍高原鳅(Tripiophysa(T.)longianalis)

　　4、细尾高原鳅(Tripiophysa(t.)stenura)

　　5、细体高原鳅(Tripiophysa(T.)leptosoma)

　　6、小眼高原鳅(Tripiophysa(T.)microps)